MiLaboratories получает $10 млн на платформенный проект для ускорения геномных исследований.

Прогрес в секвенировании ДНК и огромные объемы геномных данных, которые производятся с помощью технологии секвенирования нового поколения (NGS), открыли возможность для стартапов создавать программное обеспечение для биологов, чтобы упростить анализ этих больших данных и совершить следующий скачок. Это могло бы помочь в разработке новых вакцин, лечения рака и так далее.

За последние четыре года стартап MiLaboratories, базирующийся в Сан-Франциско с научно-исследовательским отделением в Бильбао, Испания, разрабатывает платформу вычислительной биологии, которая поможет биологам обрабатывать, анализировать и агрегировать свои данные. Она включает функции визуализации данных и генеративного искусственного интеллекта для улучшения удобства использования.

Его платформа также разработана как рынок для других ученых, чтобы они могли распространять более специализированные вычислительные инструменты в форме приложений для дальнейшего расширения функционала для научного сообщества в области геномики. Целевая аудитория MiLaboratories - ученые, умеющие работать в областях биологии, информатики и математики, так называемые биоинформатики.

Генеральный директор Стэн Пославский говорит TechCrunch: «Это подход стиля «без кода» для биологов, и мы также выпускаем [открытый исходный код] SDK — набор разработчика программного обеспечения — что позволяет биоинформатикам создавать реальные приложения».

"Во время нашей научной карьеры и карьеры наших основателей мы обнаружили огромную неэффективность в разработке современных терапий, современных лекарств", - объясняет он. "Это вызвано трениями между данными - большими данными, сгенерированными биологами, данными секвенирования, и анализом данных, который недоступен для них".

Хотя существует "тысячи" программ и инструментов, способных анализировать данные NGS, он сказал, что большинство из них были разработаны в академических кругах, где акцент сделан на функциональности, а не на удобстве использования.

Ему также требуется, чтобы биологи собирали и интегрировали результаты множества анализов. "В единой картине, которая позволяет вам понять, что происходит. И вот тут наша платформа помогает значительно," предлагает он.

Стартап надеется, что его платформа освободит биоинформатиков от необходимости заниматься рутинной работой по обработке геномных данных, чтобы эти мультидисциплинарные ученые могли применить свои навыки к более сложным задачам разработки алгоритмов, которые могли бы помочь продвигать передовую науку.

"Биоинформатики на самом деле тратят много времени на механические задачи запуска программного обеспечения для биологов", - говорит Пославски. "Для обработки этих данных необходимо иметь машины на базе Linux, соединяться через SSH, запускать сложные программные инструменты для анализа и извлечения полезной информации из данных".

"[Врачу] не хватает навыков для выполнения этого на Linux, на HPC [высокопроизводительном вычислении] кластере, потому что у него есть другие дела. И это то, чем на самом деле занимаются большинство биоинформатиков в компаниях и академии - просто ежемесячная задача запуска инструментов."

В четверг MiLaboratories официально представила свой SDK, Platforma.bio, который позволяет сторонним разработчикам создавать приложения, хотя он находился в стадии альфа и бета-тестирования несколько лет. (Пославский говорит, что "около 300 лабораторий" использовали бета-версию, и пока доступно "около 20" приложений через эту платформу.)

"Первые приложения, доступные на платформе, созданы вокруг наших биологических и биоинформационных приложений, которые очень популярны среди компаний и людей, занимающихся разработкой иммунотерапии. Но у нас уже есть хороший выбор партнерств и людей, готовых представить свои приложения на платформе, как из мире академии, так и из индустрии," - добавляет он.

Стартап, основанный в 2021 году, также объявляет о привлечении $10 миллионов в рамках серии A финансирования для дальнейшего развития с акцентом на инвестирование в создание сообщества.

Основная причина сбора средств - привлечение большего числа специалистов для развития нашей платформы. Мы нанимаем больше инженеров. Мы также нанимаем так называемых сторонников разработчиков, которые распространяют технологии в основном в академическом сообществе, поскольку большинство программного обеспечения в области биоинформатики разрабатывается в академии.

"На предстоящий год мы сосредоточим усилия на распространении технологии в сообществе и привлечении участников для создания своих приложений, интеграции их существующего программного обеспечения и предоставления их через платформу," - добавляет он.

Серия A компании MiLaboratories возглавляется мадридским Kfund, с участием Acrobator Ventures, EGB Capital, Courtyard Ventures, Somersault Ventures, Speedinvest и Ten13.

В комментарии Мигель Ариас, генеральный партнер Kfund, сказал: "Инвестирование в платформы, которые соединяют разработчиков (в данном случае биоинформатиков) и бизнес-пользователей (в данном случае биологов), является основой того, что мы хотим делать в нашем фонде. В демократизации доступа к сложным данным есть огромный потенциал, который позволяет получать иммунологические инсайты".

MiLaboratories предлагает свое программное обеспечение бесплатно для академиков, но также получает доход через платную модель для коммерческих пользователей. По словам Пославского, стартап на данный момент имеет около 100 платных клиентов.

"Многие крупные фармацевтические компании, такие как Moderna, Bristol Myers Squibb, являются нашими клиентами", - отмечает он, добавляя: "У нас есть доход - хороший доход, что позволяет нам не так сильно зависеть от венчурного капитала."

В начале 2022 года стартап привлек $2,5 миллиона венчурного капитала (seed round). Он также ранее получил небольшой предварительный инвестиционный раунд (pre-seed) от нескольких ангелов.

Обсуждая проблемы развития платформы вычислительной биологии, Пославский говорит, что огромное количество данных, генерируемых методом NGS, означает, что стартапам необходимо уделять очень внимательное внимание обеспечению эффективности обработки, чтобы избежать возникновения "невероятных затрат".

"Количество данных, генерируемых в космосе, на самом деле, ну, сумасшедшее", - подчеркивает он. "Крупные фармацевтические компании, наши клиенты ... у них есть петабайты генетических данных, накопленных на данный момент. И это огромный масштаб".

MiLaboratories разработала то, что Пославский называет "очень сложной" и "математически доказанной" технологией, которая позволяет выполнять различные вычисления "в очень оптимизированном способе". Он предполагает, что эта технология, на которую у них есть патент, позволяет платформе достигать эффективности в 10 раз выше по сравнению с некоторыми другими типами вычислительных рабочих процессов.

«Это очень важная вещь. Она скрыта от глаз биолога, потому что ценное предложение для биолога — «я хочу нажать на кнопки и получить идей» — но это очень важно для владельцев бизнеса.»

С точки зрения конкуренции, Пославски называет Seqera (и его программное обеспечение Nextflow) ближайшим конкурентом — по популярности и ценностному предложению. Существуют также открытые инструменты для обработки NGS, такие, как Galaxy, но MiLaboratories считает, что их платформа предлагает исследователям более доступный путь к анализу данных.